Struktura programu "Horyzont 2020" opiera się na trzech filarach, zakorzenionych w strategii "Europa 2020":

- Doskonała baza naukowa:
- wsparcie najbardziej utalentowanych i kreatywnych osób i ich zespołów prowadzących badania pionierskie najwyższej jakości,
- finansowanie wspólnych badań w celu znalezienia nowych i obiecujących obszarów badań naukowych i innowacji,
- zapewnienie naukowcom doskonałych szkoleń i możliwości rozwoju kariery zawodowej.

- Wiodąca pozycja w przemyśle:
- przywództwo w KET definiowanych jako: ICT, mikro-i nanoelektronika, fotonika, nanotechnologie, biotechnologia, zaawansowane materiały i zaawansowane technologie produkcji i przetwarzania, technologie kosmiczne,
- dostęp do finansowania ryzyka,
- zapewnienie wsparcia w całej UE dla rozwoju innowacji w MŚP.
- Wyzwania społeczne:

- zdrowie, zmiany demograficzne i dobrostan,
- bezpieczeństwo żywnościowe, zrównoważone rolnictwo i leśnictwo, badania mórz i wód śródlądowych oraz biogospodarka,
- bezpieczna, czysta i efektywna energia ,
- inteligentny, ekologiczny i zintegrowany transport,
- działania w dziedzinie klimatu, środowisko, efektywna gospodarka zasobami i surowce,
- Europa w zmieniającym się świecie - integracyjne, innowacyjne i refleksyjne społeczeństwa,
- bezpieczne społeczeństwa - ochrona wolności i bezpieczeństwa Europy i jej obywateli.
Nowości i ułatwienia w Programie:

• uproszczony model finansowy: UE refunduje do 100 % kosztów bezpośrednich, a w przypadku projektów innowacyjnych - do 70% kosztów kwalifikowalnych (ale w przypadku podmiotów prawnych o charakterze niezarobkowym do 100%) i 25% wydatków pośrednich, co ułatwia przygotowanie kalkulacji projektu i jego rozliczenie
• maksymalna stawka dofinansowania określona w programie pracy
• czas na przyznanie grantu skrócony z 12 do 8 miesięcy
• możliwość dwustopniowej procedury oceny wniosków (naukowcy w pierwszym etapie będą przygotowywać tylko skrócony opis projektu)
• zachowanie równowagi pomiędzy małymi i dużymi projektami,
• kwalifikowalność podatku VAT, jeśli instytucja nie może go odzyskać
• projekty realizowane przez konsorcja złożone z co najmniej 3 partnerów z 3 różnych państw członkowskich UE i/lub krajów stowarzyszonych (odstępstwo w przypadku badań pionierskich i specjalnego instrumentu MŚP, jeśli działanie ma wyraźną europejską wartość dodaną oraz działań w zakresie mobilności i działań koordynacyjnych i wspierających - projekt realizowany przez 1 podmiot prawny)
• wprowadzenie instrumentów mających na celu upowszechnianie doskonałości i zapewnianie szerszego uczestnictwa w Programie,

• wsparcie dla małych i średnich przedsiębiorstw we wszystkich działaniach programu "Horyzont 2020" - finansowanie innowacji w małych i średnich przedsiębiorstwach, także w zakresie usług, innowacji społecznych, etc.
• wprowadzenie pilotażowej procedury pn. "szybka ścieżka do innowacji" (Fast track to innovation - FTI) - przyspieszenie drogi od pomysłu do rynku, finansowanie na podstawie stale otwartego zaproszenia do składania wniosków (czas na udzielenie dotacji nie przekracza 6 miesięcy)
• zapewnienie równowagi geograficznej w panelach oceniających i grupach eksperckich Komisji Europejskiej.

Źródło informacji: http://www.nauka.gov.pl/horyzont-2020/program-horyzont-2020.html